希特勒败亡近四个月之后，日本才土崩瓦解，这有力地说明了盟国在珍珠港事件之后采取首先解决德国问题的政策是完全必要的。假如盟国采取一种优先解决太平洋问题的政策—这一政策在珍珠港事件发生后为美国海军所支持，就会为希特勒留下相当充分的时间和资源，让他能够打败苏联，进而自立为大欧亚大陆的霸主。主张首先解决德国的美国陆军和主张首先解决太平洋问题的美国海军之间不断出现紧张局面，马歇尔将军进行了睿智的判断，让美国坚持奉行前一种政策，在此方面他得到了罗斯福总统和英国政府的一贯支持。

尽管如此，美国还是将大量的武装部队投入到阻止日本巩固新赢取的帝国的努力中去。美国所赢得的绝对空中优势，使美军可以猛烈地打击日军，在利用原子弹给日本以致命一击之前，美军犹如暴风骤雨般打击日本海陆空军和大小城市，并将之摧毁。美国舰队向日本本土全力开进时，经常采取一种“越岛作战”策略—1944年10月在帕劳群岛采取的就是这一政策，纯粹避开与被隔离岛屿上无力组织反抗的日军作战，以保存部队实力，打击那些进行反击的日军。

1944年10月底，日军在莱特湾发起反攻，从日本本土上调来舰载部队，从文莱调集攻击部队，这场反攻演变为历史最大规模的海上战斗，其中共有216艘美国海军战舰，共143668人，对阵64艘日本战舰上的42.8万名海军和空军人员。此役是最后一场战舰之战，经过三天之内的四次交火，美军取得了决定性的胜利，确立了自珍珠港事件以来在太平洋战场上无可争辩的控制权。四艘日本航空母舰、三艘战列舰、六艘重型巡洋舰、四艘中型巡洋舰以及一艘潜艇被击沉，日本海军未被击沉的舰船几乎无一艘未受损伤；总计有超过10500名海军和空军人员丧生，500余架飞机被击落。与之相对，海军上将哈尔西损失了一艘轻型航空母舰、200架飞机，另有2800人遇难，1000人受伤。

1944年10月中旬，日本帝国海军遭受到了毁灭性的惩罚。11月11日，四艘驱逐舰、一艘扫雷舰，还有一艘运送10000名士兵的运兵船被击沉；11月13日，一艘扫雷舰和四艘驱逐舰被击沉，11月17日，“隼鹰”号航空母舰被击沉；11月19日，更多的日军舰船被击沉。然而日本海军还在继续战斗。日军面对半个世界的抗击所表现出的坚忍，在战略上虽然十分疯狂，但同时也会令人钦佩不已。到11月底，35架B-29轰炸机对东京进行了夜间轰炸，开始了对日本本土的毁灭性打击，其破坏程度不亚于日本海陆空军遭受的损失。

美军开始于1945年2月19日对面积狭小却有战略意义的硫磺岛发起攻击，此役也足以证明日军不会仅仅仅因为无望赢得最终的胜利而丧失斗志。英军需要占领硫磺岛以便从这里起飞战斗机护航编队为轰炸机提供保护，并将硫磺岛作为让执行完对日本本土轰炸任务的受损轰炸机返回的基地。为让美军遭受最大程度的伤亡，硫磺岛上21000名守军默默等待30000名美国海军在该岛东南登陆，等全部上岸，日军突然开火，最终美军于3月26日占领硫磺岛。硫磺岛战斗结束时，岛上仅有幸存的212名守军向美军投降，同时美国海军陆战队有6891人丧生，18070负伤。

然而，硫磺岛上的杀戮也仅占冲绳岛上阵亡日军人数的一个零头。冲绳岛是琉球群岛中的最大一岛，位于台湾和九州岛之间。因此冲绳岛成为进攻日本本土的重要跳板，日军也下定决心誓死保卫该岛。1945年4月1日，复活节当天，至少1300艘盟军舰船参加了进攻冲绳岛的行动，在大规模空中掩护下，共有60000名士兵登岸。虽然海军在前三天就已经登岸并建立了稳固的滩头阵地，但肃清岛上的日军却证明是美军战争史上极为艰巨的一项任务。海军陆战队员斯莱奇是海军陆战队第1师的一名列兵，他以自己参加冲绳岛作战的亲身经历写了一本回忆录，题为《与老杂种们为伍》，其中他回忆起持续数个星期的战斗。