阿拉伯帝国在阿拔斯统治时期，叙利亚、伊拉克和埃及地区爆发起义，动乱四起。公元754年，这位暴君死于天花。阿拔斯死后，他的弟弟曼苏尔即位。曼苏尔即位后严厉地镇压了各地的叛乱，重新统一帝国，帝国逐渐趋于安定，在他之后的三位哈里发也保持了这种局面，阿拉伯帝国进入了全盛时期。

公元762年，曼苏尔迁都巴格达，自此，巴格达成为了阿拉伯帝国的政治中心，直到1258年帝国灭亡。在哈伦继任哈里发后，阿拉伯帝国还对拜占庭帝国发起了进攻，攻占了拜占庭帝国在小亚细亚地区的部分领土，使得拜占庭帝国的皇帝被迫求和。

公元808年，撒马尔罕总督发起了叛乱，哈伦震怒，统兵亲征平叛，在途中身染重病死去。在他死后，他的两个儿子为了争夺王位展开了内战，公元813年，哈伦次子马蒙战胜了兄长马明，继任为新的哈里发。马蒙是一位开明的君主，他即位后延续了其父哈伦的政策，并对外发起了新一轮的扩张战争。

公元823年，阿拉伯帝国占领了克里特岛，拜占庭帝国受到严重打击。公元833年，马蒙亲征小亚细亚时死去，其弟穆阿台绥姆即位。穆阿台绥姆继续对拜占庭帝国用兵，但成效不大。公元842年，穆阿台绥姆死，之后阿拉伯阿拔斯王朝的势力日衰，内部矛盾日益尖锐，人民起义时有发生。自此阿拔斯王朝没有再发起过重要的对外战争，王朝走上了衰亡的道路。

随着阿拔斯王朝的日益衰落，中央的控制力逐渐变小。各行省总督和近卫军首领借机扩大自己的势力，割据自立，建立独立的王朝，这使得阿拉伯帝国开始分崩离析。

到了公元9世纪中期，帝国已经分裂为很多部分，其中最主要的分裂王朝有：塔希尔王朝，控制了波斯呼罗珊地区；萨法利王朝，在锡吉斯坦省独立，公元872年灭亡塔希尔王朝，占领波斯大部；撒玛尼王朝，公元874年建立，灭亡了萨法利王朝，是中亚地区的强国；西班牙的埃米尔王朝，公元920年，在拉赫曼带领下独立，宣称自己就是哈里发；哥疾宁王朝，建立于公元962年，统治北印度、波斯西北部、花剌子模以及锡吉斯坦。这一时期阿拔斯王朝控制的地区仅剩下巴格达和伊拉克。

公元945年，波斯将领艾哈迈德攻入巴格达，在巴格达建立了白益王朝。在白益王朝统治阿拉伯的一百多年中，阿拉伯世界再次回到了安定与繁荣中。1055年，帝国东方的塞尔柱突厥人兴起，攻入了巴格达，白益王朝灭亡，塞尔柱突厥人建立了塞尔柱王朝。1194年，塞尔柱王朝被花刺子模王朝军队击败，塞尔柱人控制阿拔斯王朝的历史从此告终。花剌子模王朝继续作为苏丹，掌握巴格达的世俗大权。

最终将伊斯兰帝国带向覆灭的挑战者，并不来自欧洲，而是来自中亚的蒙古。在13世纪早期，名为成吉思汗的蒙古领袖和他的家族征服了今天中国、俄罗斯、伊朗和伊拉克的大部分地区。自1219年起，成吉思汗开始侵袭伊斯兰地区。他在今天的乌兹别克斯坦一带建立了统治，并一直向南进军到伊朗北部。1256年，成吉思汗的孙子旭烈兀继续向前，纵贯波斯，直到伊拉克。1258年，旭烈兀征服了巴格达，并彻底结束了阿拔斯王朝的统治。持续了六个世纪的阿拉伯帝国至此灭亡。

虽然1260年前后蒙古人的入侵毁灭了伊斯兰帝国，然而伊斯兰教的力量依然强大。蒙古入侵者最终也皈依的伊斯兰教。50年间，波斯和伊拉克的蒙古统治者相继宣布伊斯兰教为国教。帝国已逝，然而伊斯兰教依然活跃于中东、非洲和亚洲地区。奥斯曼帝国最最后的伟大伊斯兰国家之一，它统治着小亚细亚和巴尔干半岛。奥斯曼人在16世纪开始自称哈里发，其存在至1922年。