公元前 47 年，也就是庞培死后一年，局势对恺撒来说依然非常险恶。首先，他已经离开政治中心罗马近一年，而代他主持罗马事务的副手马克·安东尼据说把罗马搞得一塌糊涂；其次，庞培派势力依然不可小觑，梅特鲁斯·西庇阿、小加图等人已经在非洲集结起号称 10 个军团，并且和罗马的宿敌努米底亚国王朱巴一世勾结在一起。西班牙，庞培生前的大本营此刻也蠢蠢欲动，有消息称，从亚历山大港逃出的庞培妻、子逃往了此处。

让恺撒更为头疼的其实是罗马的局势。在整个前 47 年，恺撒一度和罗马断绝音讯达 6 个月之久，使得罗马政坛波谲云诡。原本是恺撒派的凯利乌斯.鲁弗斯因为恺撒没有给予他满意的官职而掀起了暴动，而与他联合的则是被庞培流放的米罗。

闹剧般的暴动很快就被平息，凯利乌斯和米罗也被击败处死。然而，暴动剧情却隐隠暴露出罗马内战中一些现实问题：首先是内战中的各派支持者动机复杂，除了极少数人之外，不少都是浑水摸鱼的政客，别看他们整天高喊“自由”“人民”，一旦触动他们自己的利益，保证跳得比谁都高；此外人们也要看到，任何野心家只要抓住一两个流量密码，就能在罗马煽动对立掀起风暴，根本算不上啥人物的凯利乌斯只需打出比恺撒更为激进的“免除债务”号振臂一呼，居然都能应者云从，足见当时社会问题之严重。

前 2 世纪前后，罗马制服迦太基独霸全地中海，攫取了巨额财富，但这笔财富并不是均匀分配给每一个人的。在战争中发财的新贵将财富投入农业之中，使得土地兼并问题凸显。更要命的是，随着罗马疆域的扩大，她同其他国家的接触、矛盾自然会增多，随之发生接连不断的海外战争压力恰恰又主要落在小农户身上。

大批小农户入伍，成为脱产职业士兵。几十年持续下来，农民要么入伍靠战争虏获维生，但退役后生活没有着落；要么就在大庄园兼并下破产，进入城市靠国家提供的福利勉强度日。一方是站在金字塔顶尖极少数衣食无忧的精英，另一方是大批丧失土地勉强度日的贫民，社会如此割裂，矛盾积抚攒日复一日。决裂只是迟早的事情。阶级分化矛盾，同旧贵族（元老）和新兴势力（骑士）、意大利诸城的罗马公民和非公民间权力斗争交织在一起，使得罗马共和国矛盾错综复杂，危机四伏。

士兵因为服役失去土地，唯有恺撒明确允诺在战后分给他们土地，同时也只有恺撒向长期为罗马共和国效力的外邦士兵允诺了罗马公民权。对于为共和国流血流汗一辈子的老兵来说，跟着谁走的问题简直不辩自明。不仅仅是对待这些老兵，恺撒的大多数政见都类似于此，虽然并不见得能在政坛上赚取眼球和流量，但却都是实打实地有益平民，从某种角度来说，恺撒真正力量就在于此。

公元前 47 年 12 月，恢复了罗马秩序，并做好后勤准备的恺撒再度出发，前去征讨盘踞在北非的庞培派。由于是冬季渡海作战的缘故，恺撒的部队是分散抵达北非沿岸的。恺撒登陆时身边只有 3500 步兵和 150 骑兵，他下船时还摔了一跤，为了化解手下对这不祥之兆的惊慌，他立刻用双手抓起了砂石，然后大声宣布：“我抓住你了，阿非利加。”

这次恺撒的对手是梅特鲁斯·西庇阿、小加图、拉比埃努斯、阿弗拉尼乌斯、佩特列乌斯，主力是小加图带到非洲未参加法萨卢斯之战的庞培军。在北非，他们将其扩充到了 10 个军团，虽然不一定满员，但得到了曾长期同罗马作对的努米底亚的支持，国王朱巴一世特别提供了一支在罗马军队眼中都堪称强大的骑兵部队，此外还有 120 头战象。

如果庞培派集中兵力发起反击，估计当场就能把恺撒赶下海去。好在对手似乎更擅长的还是在元老院讲坛上夸夸其谈，居然没有人料到恺撒会在冬季渡过地中海发动战争，更没有人想到要在手中保留一支机动部队以应变。恺撒大军散装抵达北非，但庞培军也是散装等在北非各地，等西庇阿将军队收拢，恺撒早就准备好了。经过差不多 4 个月的对峙和小规模冲突，决定北非庞培派命运的塔普苏斯会战终于到来了。

公元前 46 年 4 月初，朱巴一世率领 3 个“军团”、800 名重骑兵和大量努米底亚骑兵和轻步兵同庞培派会合，恺撒获悉此事，认为这是将原本分散在各处的敌人一举消灭的绝佳机会，命令军队主动迎击。6 日早上，大战爆发，庞培派军队循规蹈矩排出了三道，骑兵分布在两翼。然而，由于地势狭窄原因，骑兵施展不开，大部分努米底亚骑兵只能跟在朱巴一世身边，无法在统一指挥下发挥应有战力。

恺撒则选择简单的迎头抗击，因为他的部队更有经验，士气高昂，只要敌人无法形成包抄就有更多胜算。战斗打响之后，恺撒麾下士兵早按捺不住，纷纷主动出击向敌军推进，庞培派左翼的战象很快就被冰雹般的投射武器吓得乱作一团，首先崩溃。

而恺撒军乘机突破，发起狠的老兵对同胞也毫不手软，据说当天就让 10000 多庞培派士兵战死沙场，而己方只有 50 多人伤亡。庞培派主将大多逃过了战死但没逃过追杀：阿拉尼乌斯和苏拉的儿子福斯图斯被处死；佩特列乌斯和朱巴一世自杀；梅特鲁斯.西庇阿想从海路逃走，但被抓住后自杀；唯有拉比埃努斯逃到了西班牙，同庞培的儿子格涅乌斯和塞克图斯会合。

小加图没有参战，在后方留守庞培的最后据点乌提卡，但他心里清楚大勢已去。在和友人吃过晚饭、拥抱了儿子、同在场所有人告別后，小加图回到卧室，像往常一样睡前读柏拉图，当天读的是探讨灵魂不朽的《斐多篇》。然后，他毫无征兆地拿起了短剑剌向自己腹部。儿子和友人听到动静冲进来救活了他，但恢复知觉后，小加图决绝地撕开伤口，“像野兽一样”将内脏抖散出来，以极端痛苦的方式结束了自己的生命。

从恺撒跨过卢比孔河算起，不过 3 年多，大多数反对他的权贵都已经死了，幸存者也基本放弃了战斗。