“9.11”恐怖袭击之后，布什政府提出了反国际法规则的所谓“先发制人”政策，被称为“布什主义”，即在国家安全政策和对外交往中遵循“美国利益至上”和“以实力求和平”两大原则，对恐怖主义和谋求核武器、大规模杀伤性武器的不友好国家采取先发制人的打击政策，在全球地缘战略格局上以更具进攻性的军事部署为基础，采用强硬态度追求美国的国家利益。在“反恐”名义下，布什发动了阿富汗和伊拉克战争两场战争，将“布什主义”推向了极致。
“9.11”事件后，美国以阿富汗塔利班政权拒绝交出涉嫌策划“9. 11”恐怖袭击的“基地”组织头号人物本拉登为由，发动军事行动，打击塔利班政权。塔利班是一个伊斯兰宗教激进主义组织，由奥马尔于 1994 年在巴基斯坦与阿富汗边境成立。“塔利班”源于阿拉伯语，意为“学生”，如此命名源于成员多是当地不满军阀混战的学生。
2001 年 10 月 7 日，美国发起了代号为“持久自由”的军事打击行动，对阿富汗盖达组织和塔利班发起战争，标志美国反恐战争的开始。美军动用 15 架轰炸机，25 架战斗机，6 小时内实施 4 轮轰炸，攻击30 多个阿富汗境内目标。截止到 2001 年 12 月 31 日，美军共出动作战飞机 5000 架次以上，投射炸弹导弹 1.2 万多枚，其中 60%以上是精确制导弹药。通过军事打击行动，塔利班政权被推翻，“基地”组织在阿富汗的网络基本被摧毁 。
阿富汗战争是美国以“反恐”名义发动，以空中精确打击为主要打击样式的战争。由于双方实力对比悬殊，属于非对称战争。2011 年 5 月 1 日，奥巴马宣布美国特种部队在巴基斯坦境内击毙了本拉登。2014 年 12 月 29 日，美国总统奥巴马正式宣布阿富汗战争结束。